モデル情報

ProstT5

Rostlab · ProstT5

ProstT5 is a protein language model (pLM) which can translate between protein sequence and structure. ProstT5 (Protein structure-sequence T5) is based on ProtT5-XL-U50, a T5 model trained on encoding protein sequences using span corruption applied on billions of protein sequences. ProstT5 finetunes ProtT5-XL-U50 on translating between protein sequence and structure using 17M proteins with high-quality 3D structure predictions from the AlphaFoldDB. Protein structure is converted from 3D to 1D using the 3Di-tokens introduced by Foldseek. In a first step, ProstT5 learnt to represent the newly introduced 3Di-tokens by continuing the original span-denoising objective applied on 3Di- and amino acid- (AA) sequences. Only in a second step, ProstT5 was trained on translating between the two modalities. The direction of the translation is indicated by two special tokens ("\ " for translating from 3Di to AAs, “\ ” for translating from AAs to 3Di). To avoid clashes with AA tokens, 3Di-tokens were cast to lower-case (alphabets are identical otherwise). - **Developed by:** Michael Heinzinger (GitHub @mheinzinger; Twitter @HeinzingerM) - **Model type:** Encoder-decoder (T5) - **Language(s) (NLP):** Protein sequence and structure - **License:** MIT - **Finetuned from model:** ProtT5-XL-U50

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情報更新日時2026/11/2 19:15:43
OVERVIEW

モデル紹介

ProstT5 is a protein language model (pLM) which can translate between protein sequence and structure. ProstT5 (Protein structure-sequence T5) is based on ProtT5-XL-U50, a T5 model trained on encoding protein sequences using span corruption applied on billions of protein sequences. ProstT5 finetunes ProtT5-XL-U50 on translating between protein sequence and structure using 17M proteins with high-quality 3D structure predictions from the AlphaFoldDB. Protein structure is converted from 3D to 1D using the 3Di-tokens introduced by Foldseek. In a first step, ProstT5 learnt to represent the newly introduced 3Di-tokens by continuing the original span-denoising objective applied on 3Di- and amino acid- (AA) sequences. Only in a second step, ProstT5 was trained on translating between the two modalities. The direction of the translation is indicated by two special tokens ("\ " for translating from 3Di to AAs, “\ ” for translating from AAs to 3Di). To avoid clashes with AA tokens, 3Di-tokens were cast to lower-case (alphabets are identical otherwise). - **Developed by:** Michael Heinzinger (GitHub @mheinzinger; Twitter @HeinzingerM) - **Model type:** Encoder-decoder (T5) - **Language(s) (NLP):** Protein sequence and structure - **License:** MIT - **Finetuned from model:** ProtT5-XL-U50

主な特徴

特点摘要待依据来源补齐,不凭模型名称推断能力。

制約と注意点

具体的な制約を判断する出典が不足しています。実際の性能、遅延、データ方針、ライセンス、提供期間を確認してください。

PRICING & COST

出典別料金と費用分析

料金はチャネル・地域・設定によって異なります。各チャネルの料金は個別に表示し、提供元の統一公式料金とは見なしません。

出典・チャネル入力出力課金単位収集日時
確認可能な料金がありません。出典を確認してください。

月額の基本トークン費用を試算

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試算はキャッシュ割引、段階料金、マルチモーダル追加料金、検索、税金、追加推論出力を含みません。

INDEPENDENT BENCHMARKS

公開評価と実行設定

暂无已采集的可核验公开评分。模型未上榜不代表能力较低。

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よくある質問

オープンウェイトなら無料で商用利用できますか?

必ずしもそうではありません。バージョン別のライセンス、商用条件、利用方針を確認してください。自前運用には計算資源と保守費用も必要です。

これはリアルタイムの請求料金ですか?

収集日時付きの料金スナップショットです。最新のバージョン、地域、割引、課金方式は各チャネルで確認してください。

出典と追跡記録

许可证:mit。模型介绍与第三方评测均以原来源的具体版本和方法为准。